سید علی حبیبی موسوی خامنه (۴۳ ساله ۱۲) خواهرزاده میرحسین موسوی بود که در ۶ دی ۱۳۸۸ در جریان مراسم عزاداری روز عاشورا کشته شد. زندگی شخصی سید علی موسوی در زمان مرگ دارای یک دختر ۱۷ ساله و یک پسر ۷ ساله بود. ابراهیم موسوی برادر او پیش از این در جنگ کشته شده‌است.۲ مرگ سید علی موسوی ظهر ۶ دی ۱۳۸۸ (عاشورا)، در جریان تظاهرات روز عاشورا از ناحیه کتف هدف گلوله ۳ قرار گرفت و قبل از انتقال به بیمارستان ابن سینا واقع در فلکه دوم صادقیه جان باخت.۴۵ تهدید به گواه شاهدان، پیش از مرگ در چند نوبت مورد تهدید تلفنی قرار گرفته بود.۱ ترور به نوشتهٔ سایت جنبش راه سبز: «براساس گزارش شاهدان عینی، روز عاشورا حوالی ساعت ۱ تا ۲ بعدازظهر یک اتومبیل پاترول مشکی رنگ با چهار سرنشین لباس شخصی با سرعت هرچه تمام‌تر به سمت مردمی که در خیابان شادمان حضور داشتند یورش برد که ابتدا دو نفر را زیر گرفت و از روی یکی از آنها به طور کامل رد شد، نفر کنار راننده هم مسلح به سلاح کمری بوده و در طول حرکت، چند گلوله به سمت مردم شلیک کرد و سپس طول خیابان شادمان را به همین صورت طی کرده، دور زد به سمت خیابان آزادی برگشت. بعد از رفتن پاترول چند نفر زخمی و تیرخورده روی زمین افتاده بودند که مردم به کمک آنها رفتند. با توجه به شواهد خواهرزاده میرحسین موسوی هم در همین منطقه تیر خورده و به قتل رسید.» براساس این گزارش دو یا سه موتورسوار نیز اتومبیل پاترول را همراهی می‌کردند و هزاران نفر مردمی که در خیابان شادمان حضور داشتند شاهد این صحنه بوده و برخی حتی می‌توانند چهره ضارب را شناسائی کنند. سرنشینان اتومبیل فوق بعد از انجام این جنایت وارد اتوبان یادگار امام شده، در لاین شمال به جنوب توقف کرده و با نیروهای بسیجی حاضر در محل گفتگو کرده‌اند. طبق مشاهدات شاهدان عینی، شخص ضارب که با کلت به مردم شلیک می‌کرد «جوانی ۱۹-۲۰ ساله با ریش و سبیلی کم پشت و هنوز سبز نشده بوده و لباس کرم رنگ به تن» داشته است.۶ نیروهای امنیتی پس از مرگ با حضور در بیمارستان مورد اشاره بر انتقال جسد آقای موسوی به پزشکی قانونی کهریزک اصرار می‌ورزیدند.۱۲ جسد سیدعلی موسوی از بیمارستان ابن‌سینا منتقل شده‌است و هیچ اطلاعی از محل جسد در دست نیست، برادر مقتول، سیدرضا موسوی گفته‌است:«تا زمانیکه جنازه را پیدا نکنیم برگزاری هرگونه مراسمی منتفی است.» ۷ نیروهای امنیتی خانواده مقتول را تهدید کرده‌اند که حق برگزاری مراسم را ندارند. احتمال آن وجود دارد که شبانه پیکر او را مخفیانه به خاک بسپارند تا مانع از مراسم تدفین او شوند.۲ در این حال ایرنا، خبرگزاری رسمی دولت ایران در گزارشی نوشته‌است که جسد حبیبی موسوی «به همراه ۴ تن دیگر از کشته شدگان اغتشاشات تهران به منظور تکمیل تحقیقات کالبدشکافی و پلیسی و یافتن سرنخ‌های بیشتر» نگهداری می‌شود.ایرنا هیچ اشاره‌ای به مفقود شدن جنازه‌ها نکرد. برخی رسانه‌های نزدیک به معترضان در ایران می‌گویند که نگهداری این اجساد برای جلوگیری از تبدیل شدن تشییع جنازه آنها به موقعیتی برای اعتراضات تازه‌است.۸۹ واکنش‌ها پس از انتقال به بیمارستان و مرگ، میرحسین موسوی، والدین وی و جمعی از شخصیت‌های سیاسی در این بیمارستان حاضر شدند.۵ به گزارش جرس، بدنبال انتشار خبر کشته شدن علی موسوی چند گروه از معترضین بسوی این بیمارستان در فلکه دوم صادقیه رفتند.۱۰ سایت رجانیوز از خبرگزاری‌های نزدیکان به دولت این اتفاق را به «تیم‌های ترور ضد انقلاب» نسبت می‌دهد. به گفته خبرگزاری امیرکبیر سایت رجانیوز در اشتباهی فاحش محل قتل را در چهارراه کالج گزارش داد.۱۱۱ پیام‌های تسلیت میرحسین موسوی به نقل از سایت جنبش راه سبز میرحسین موسوی حاضر به انتشار بیانیهٔ ویژه‌ای برای خواهرزاده‌اش نشد و گفت: «او نیز مانند دیگر درگذشتگان جنبش سبز مثل سهراب و اشکان است.»۱۲ خانوادهٔ بهشتی خانوادهٔ بهشتی این رویداد را به میرحسین موسوی تسلیت گفت.۱۳ مهدی کروبی مهدی کروبی با انتشار پیامی جان‌باختن «علی موسوی» خواهرزاده میرحسین موسوی را به وی و ملت ایران تسلیت گفت.۱۴۱۵ یوسف صانعی شب ۶ دی ۱۳۸۸ یوسف صانعی در تماس تلفنی با میرحسین موسوی ضمن اظهار تاسف و تالم شدید از وقایع و فجایع ظهر عاشورای حسینی در تهران، به قتل رسیدن سید علی موسوی را به میرحسین موسوی و خانواده مقتول تسلیت گفت.۱۶ سازمان مجاهدین انقلاب اسلامی سازمان مجاهدین انقلاب اسلامی با صدور بیانیه‌ای قتل سید علی موسوی را به میرحسین موسوی تسلیت گفت.۱۷ سید علی‌محمد دستغیب سید علی‌محمد دستغیب با انتشار پیامی، «شهادت» خواهرزاده میرحسین موسوی و دیگر شهدای روز عاشورا را تسلیت گفته وخواستار شناسایی قاتلین و محاکمه آنها شد.۱۸ جامعه پزشکی ایران انجمن اسلامی جامعه پزشکی ایران با انتشار نامه‌ای خطاب به میرحسین موسوی، شهادت سید علی حبیبی موسوی و سایر شهدای روز عاشورا را تسلیت گفت.۱۹ همچنین در روزهای پس از این حادثه، سید محمد خاتمی، مهدی کروبی، سید هادی خامنه ای و تنی چند از اعضای مجمع نیروهای خط امام(ره) به همراه اعضای سازمان جوانان و دانشجویان مجمع نیروهای خط امام (ره) جهت همدردی با خانواده وی جداگانه در خانه پدری ایشان حضور یافتند و با میرحسین موسوی دیدار کردند.۲۰۲۱۲۲ تشییع پیکر و خاکسپاری به گفتهٔ پایگاه اینترنتی کلمه: «صبح روز چهارشنبه مسئولان با خانوادهٔ علی موسوی تماس گرفته و به آنها گفتند که اجازهٔ دفن در بهشت زهرا داده شده است. بعد از این تماس پیکر علی حبیبی موسوی در بهشت زهرای تهران با تدابیر شدید امنیتی و با حضور خانوادهٔ موسوی به خاک سپرده شد.» همچنین به نوشتهٔ کلمه: «زمان خاکسپاری به منظور عدم اطلاع‌رسانی و حضور مردم در مراسم تشییع ساعتی پیش از تشییع به خانواده اعلام شده است.» کلمه همچنین می‌گوید: «یک روز پس از کشته شدن علی حبیبی موسوی جنازه وی بدون اطلاع خانواده از بیمارستان منتقل و با پیگیری‌های صورت گرفته اعلام شد که جنازهٔ او به پزشک قانونی منتقل شده است.